辞职工厂扣员工工资，存在特殊情形会影响结果。
1. 另有合法约定的情况：若员工入职时与工厂签订的劳动合同明确约定辞职需承担特定费用（如《劳动合同法》第二十二条、第二十三条规定的服务期违约金或竞业限制违约金），且约定不违反法律强制性规定，工厂可依约扣除相应费用，此时扣工资可能合法。例如，员工违反服务期约定辞职，工厂可按约定扣部分工资作为违约金，但数额不得超过服务期未履行部分分摊的培训费用。
2. 未履行法定通知期义务的情况：根据《劳动合同法》第三十七条，员工需提前三十日书面通知或试用期内提前三日通知工厂辞职。若员工未提前通知擅自离职，给工厂造成实际经济损失，工厂在举证损失存在后，可从工资中扣除相应赔偿，但扣除后工资不得低于当地最低工资标准，此时扣工资具有合法性。
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辞职工厂扣工资，可能存在法律风险。
1. 支付赔偿金的风险：若工厂违法克扣工资，根据《劳动合同法》第八十五条，劳动行政部门责令限期支付后仍不支付的，工厂需按应付金额50%-100%向员工加付赔偿金。例如，员工月工资5000元，工厂违法克扣2000元，经责令支付仍不支付，工厂可能需支付2000元以上4000元以下赔偿金。
2. 行政处罚的风险：劳动行政部门调查发现工厂克扣工资，可能对其作出警告、罚款等处罚。如某工厂多次违法克扣工资，劳动监察部门可罚款并记入信用档案，影响其社会信誉。
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辞职工厂扣工资问题处理中，员工易有错误操作需避免。
1. 冲动离职后消极应对：部分员工发现工厂扣工资后，采取旷工、损毁财物等极端方式对抗，这不仅无效，还可能违法，甚至面临工厂索赔。
2. 忽视证据收集：员工未重视证据保存，如劳动合同、工资条、辞职记录等，导致维权时无法证明扣工资事实及应得工资数额，处于不利地位。
3. 超过维权时效：劳动争议仲裁时效为一年，从知道或应当知道权利被侵害时起算。部分员工拖延维权，超时效后可能丧失胜诉权。
若已出现类似错误或不确定如何正确维权，可随时咨询我，我会为您提供专业解答和帮助。
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辞职工厂扣工资是否违法，需结合具体情况判断。仅因员工辞职无合法理由扣工资，行为违法。
1. 员工未提前通知擅自离职且造成损失的：工厂可依据劳动合同或合法有效的规章制度，在合理范围内扣除工资弥补损失，但扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
2. 工厂以辞职为由扣除不符合法定情形的费用（如未签服务期或竞业限制协议的“违约金”“培训费”）的：扣除行为违法。
3. 员工因工作过错导致工厂直接经济损失，工厂能提供充分证据证明损失金额的：可按规定程序和比例扣工资，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%。

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